收到上级法院改变管辖决定书后，根据相关的规定，如果是公家起诉案件，应当书面通知同级人民检察院，并将案卷材料退回，同时书面通知当事人；如果是自诉案件，应当将案卷材料移送被指定管辖的人民法院，并书面通知当事人。对改变管辖的民商事案件，法院应当在收到案卷材料后的三日内立案。

　　什么情况下刑事案件指定管辖

　　1、由于特殊原因，有管辖权的法院不能行使管辖权。

　　2、法院间管辖权争端。如果下级法院对特定行政案件的管辖权存在争议，则应相互协商。如果谈判失败，他们可以向共同的上级法院报告，上级法院应以指定的形式解决冲突或争议。从实际的角度来看，主要存在这样的情况：

　　（1）积极的冲突，即两个或两个以上的法院认为他们对案件具有管辖权；

　　（2）它们是负面冲突，即两个或两个以上的法院认为他们对案件没有管辖权，它应被其他法院接受。

　　法律依据

　　《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国刑事诉讼法〉的解释》第二十二条。

　　《刑事诉讼法》第27条规定：上级人民法院可以指定下级人民法院审判管辖不明的案件，也可以指定下级人民法院将案件移送其他人民法院审判。

　　《民诉法》第37条规定：有管辖权的人民法院由于特殊原因，不能行使管辖权的，由上级人民法院指定管辖。人民法院之间因管辖权发生争议，由争议双方协商解决;协商解决不了的，报请它们的共同上级人民法院指定管辖。

　　第127条    人民法院受理案件后，当事人对管辖权有异议的，应当在提交答辩状期间提出。法院对当事人提出的异议，应当审查。异议成立的，裁定将案件移送有管辖权的人民法院；异议不成立的，裁定驳回