劳动仲裁赔偿要交税，但应该由企业代扣代缴。代扣代缴个人所得税是行政法规税法规定的义务。法院属于司法执法。不是行政执法。法院判企业支付工资，企业执行司法程序按判决书支付工资。同时企业又必须执行税务行政法规，支付工资时代扣个人所得税。这是企业执行必须执行的两个法。

　　劳动仲裁的经济补偿金要交税吗

　　1、根据财政部、国家税务总局《关于个人与用人单位取得的一次性补偿收入免征个人所得税问题的通知》中规定：个人因与用人单位解除劳动关系而取得的一次性补偿收入（包括用人单位发放的经济补偿金、生活补助费和其他补助费用），其收入在当地上年职工平均工资三倍数额以内的部分，免征个人所得税；超过的部分按照《国家税务总局关于个人因解除取得经济补偿金征收个人所得税问题的通知》计算征收个人所得税。

　　2、超过平均工资3倍的部分需要缴纳个人所得税。如果劳动者的月平均工资在本地区上年度职工月平均工资三倍以内，比如2.5倍，就不会受十二年的限制，这时劳动者可以拿超过12个月的经济补偿金，这超过的部分就有可能在当地上年职工平均工资三倍数额以上，这部分还是要纳税。

　　法律依据

　　《中华人民共和国税收征收管理暂行条例》

　　第六条凡从事生产、经营，实行独立经济核算，并经工商行政管理部门批准开业的纳税人，应当自领取营业执照之日起三十日内，向当地税务机关申报办理税务登记。其他有纳税义务的单位和个人，除按照税务机关规定不需办理税务登记者外，应当在按照税收法规的规定成为法定纳税人之日起三十日内，向当地税务机关申报办理税务登记。

　　第八条纳税人申报办理税务登记，应提出申请登记报告和有关批准文件，同时提供有关证件。主管税务机关对前款报告、文件、证件审核后，予以登记，发给税务登记证。税务登记证只限纳税人使用，不得转借或转让。税务登记的内容包括：纳税人名称、地址、所有制形式、隶属关系、经营方式、经营范围以及其它有关事项。